中华军在1666年开年之后还是没有发兵北上的计划，清军的江北防线搞的有模有样，十分的严密，中华军这边如果要进攻的话，则势必是全军出动，不然的话根本就打不动清军的防线，但是现在的物资以及弹药的储备情况也是不支持大规模的作战的，所以这一段时间中华军没有大的动作。
不过这并不意味着中华军就闲了下来，这个时候，在南方的很多地方都有十分严重的匪患情况，在乱世之中，这些土匪往往杀害的百姓比入侵的外敌还要多。
项玉在回基隆之前下达的最后一个命令就是让各地的军队负责剿匪，而这个任务并不轻松。
这个时候，仅在福建一地就有大大小小的数百只土匪，他们盘踞在各个山头，比较大的有漳州府的大峰山土匪、鸟山土匪，龙岩的东宝山土匪，汀州的武平寨土匪还有很多杂七杂八的大小土匪。
这些土匪的兵力加起来超过了十万人，是一个不小的势力，不过因为他们被分散到各地去了，所以才没有对中华军造成比较大的威胁，而且因为中华军在之前表现出来的强大战斗力，使得这些人大为忌惮，就连平日里的活动都约束和收敛了很多，显然是不想触中华军的眉头。
中华军首先派人向这些大大小小的土匪传话，要求他们在接到消息一个月内下山向当地的中华军投降，不然的话中华军就会前去围剿。
很多土匪其实是由难民组成的，也有很多是当地的强人起了歹心，裹狭着百姓逃窜到了山上，当起了山大王，他们的主要组成都是各地的农民，农民会种田不会打仗，于是这些土匪便圈占了一定的区域，在里面种田耕地，很多土匪干脆就不出去劫掠了。渐渐的这样的土匪群就像是一个大的村落一样了。
对于这样的土匪，中华军主要的措施是招抚，在保证他们不会对其他人造成威胁的情况下面，先解散他们的武装。至于他们开垦的那些土地，可以分给他们耕种，只要他们手中没有粘上无辜百姓的鲜血，中华军都会对他们过往的事情不计较，将其和其他百姓一样对待。要是他们想回到家乡，中华军也能够安排，并且还会给他们提供新的土地耕种。
但是对于那些穷凶极恶杀人如麻的土匪，中华军都是直接采取强攻剿灭的方式，只要他们不下山投降，就会派军前去攻打，对于负隅顽抗的人全部都严肃处理，按照他们过往的罪行进行审理之后定罪处理。
在中华军的政策公布之后，很多小股土匪都选择了向中华军投降，毕竟他们没有干太多的坏事。论武力也远非中华军的对手，所以就很识相的选择了放弃抵抗。
针对这些土匪，中华军对他们的身份进行一一核实，并且到附近村庄去走访调查，看看他们是否做过什么伤天害理的事情，若是没有做过的话，那他们就不会被定罪，而是会根据他们的意愿进行分配。
光是这些小股的土匪就多达几百支，人数超过两万人，在将他们处理完了之后。剩下还有不到五十支较大规模的土匪，这些土匪的人数一般都在五百人以上，有的甚至有四五千人的规模，中华军见他们没有动作。于是挑选了其中的一批作恶多端的土匪进行剿灭，然后公开审理处理，以起到一个杀鸡儆猴的效果，在这之后再向他们发出最后通牒，要求他们在十天时间之内向中华军投降，不然的话就不再享受宽大处理了。
这样一来又将十几支土匪吓出来投降了。不过依然有接近三十支大型土匪不肯就范，这些人大多