军民人等丢下的盔甲、器械，真是堆积得像山一般，待将进关的军民人等放完之后，熊廷弼又差人一一盘点入库。熊廷弼此举不仅保全了辽东百万难民，又得到了不少盔甲、器械，也增加了山海关的守备力量。
王化贞与辽东各路关员此时也进入山海关中，广宁失陷后，祖大寿为避祸，逃往觉华岛，方震孺向熊廷弼献计道：”我愿意为经略将祖大寿招回来！“熊廷弼大喜，召来总兵张国卿，跟他商谋曰：“我听闻建虏为攻击山海关，四面搜索粮草，听闻祖将军在觉华岛上有米、豆二十余万，将士、百姓十余万人，战舰、器仗、马、牛无数，建虏如果能得到岛上的将士、军需，再用他们来攻打榆关（山海关的别称），榆关如何能保得往呢？”
方震孺、张国卿就此辞别了熊廷弼，出海航行到了觉华岛，他们在觉华岛上找到了祖大寿，祖大寿听完方震孺的讲辞后，面露难色，久久不作声；方震孺、张国卿几次催祖大寿回山海关，他都推自己还要考虑一番；。
方震孺知道祖大寿尚有疑虑，普通的言辞恐怕很难打动他的心；方震孺心里盘算了一番后，一咬牙下了决心，猛地一下抽出随身携带的宝剑，架在自己的脖子上，慷慨对祖大寿道：“今，国家已经到了最危急的关头，将军如果听我的话回到山海关，我保将军‘富贵荣华’、‘享之不尽’；如果将军不愿意回山海关，震孺就用自已颈上的血来溅醒将军。”
祖大寿被方震孺的忠义所感动，泣不成声，方震孺亦痛哭流泣，祖大寿于是和方震孺一起回山海关，获得了无数军民辎重。建虏追逐王化贞等人二百余里，因为熊廷弼“坚壁清野”工作作得彻底，他们得不到被给，不得已只能退回。
听到广宁失败的消息，京城人心惶惶，启二年二月，王化贞被捕，熊廷弼也被阉党弹劾，免职听侯审判，原来王化贞本是东林党人，东林党人对王化贞相当重视，正在为营求他奔走的时侯，王化贞见朝中阉党当权，立刻改换门庭投靠阉党，阉党于是将祸水引向熊廷弼，反诬陷他是广宁之战失利的责任人。
张鹤鸣怕皇上和朝臣们怪罪他，也在熊廷弼身上倒脏水，不光附和阉党对熊廷弼的攻击，还冤枉熊廷弼贪污受贿：“今下事岂不皆以贪坏，而辽东尤甚。向来镇、抚、道、将以下，每任满，率人人渔猎官私金钱，多至数万计。”，又他身边有建虏的奸细佟卜年，更诬蔑他私退建虏。
太仆寺少卿满朝荐仗义直言，为熊廷弼抱曲道：“辽阳之祸，起于袁应泰之纳降，被降夷尽占居民妇女，故辽民发愤，招奴攻城。事发仓卒，未闻有何人献送之也。广宁之孽，起于王化贞饷金以啖西虏而不给卒伍，偶有声息，驱之城外，捍御谬闻。奴酋过河又不见西虏策应，不觉手脚慌忙，抱头先走，亦事发仓卒，未闻有何人献送之也。深求奸细